脂肪肝会影响肝功能。单纯的脂肪肝只是脂肪在肝脏内堆积，并没有引起肝脏炎症。但如果脂肪肝没有控制，进一步发展则会形成脂肪性肝炎。
因为脂肪具有脂毒性，在肝脏内沉积后会氧化肝细胞，导致肝细胞损坏出现肝脏炎症，从而引起肝功能异常、转氨酶升高。对于已经引起脂肪性肝炎的患者，需要立即予以药物进行护肝降酶治疗。否则，肝脏的持续炎症将会破坏肝脏内部结构，导致进展为肝硬化，甚至还会引发肝癌。
控制肝脏炎症的药物比较多，具有代表性的是甘草酸制剂，这类药物能够有类激素样作用来控制肝脏细胞炎症。