男性的生殖器畸形有可能会遗传到下一代。导致男性生殖器官畸形的病因可能是因为在胚胎时期发育异常，也可能是因为基因突变或染色体异常所引起。
对于胚胎发育异常导致的生殖器官畸形，由于其基因和染色体并无明显的异常，所以通常不会导致遗传，而对于有染色体异常导致的生殖器官畸形，这种情况下可以遗传。
在备孕之前应该收集家族的遗传病史，在母亲怀孕之后要及时的进行检查，做好优生优育。如果出现生殖器畸形的几率较大的时候，必要的时候可以终止妊娠来避免这种情况发生。