艾滋病窗口期一般不存在明显症状，偶有敏感人群出现不适症状，也不具备特异性，需要与多种常见疾病进行鉴别。
艾滋病感染窗口期人群体内病毒浓度相对较低，对身体侵袭性弱，机体反应性低，临床症状较弱。大部分人不能明确感知，较为敏感人群可出现发热、乏力、皮疹、腹泻等情况，大多可在短时间内自动缓解。
如存在艾滋病病毒危险性接触，不能依靠症状对艾滋病进行判断，一般需要定期进行艾滋病病毒检测协助诊断。