运动后后脑勺疼，多考虑可能是由于运动过程当中出汗较多，而出汗后导致机体当中散发出了较多的热量。这种情况下，如果头部受到冷风刺激，很容易导致脑血管过度痉挛、收缩，致使大脑缺血、缺氧，便可引起后脑勺疼痛。
也可能是由于剧烈运动，导致大脑神经过度兴奋、紧张，致使脑血管舒张、收缩功能产生障碍，造成脑血管过度痉挛，致使后循环缺血，也会引起后脑勺疼痛。
另外，还可能与偏头痛有关。如果运动时间过长、运动强度过大，导致呼吸频率加快、造成脑血管扩张，容易诱发偏头痛，也可出现后脑勺疼痛。