重度萎缩性胃炎多不可以自愈，但是经过积极治疗以后多可以改善患者所出现的不适症状。
患有重度萎缩性胃炎的患者，一般多会选择药物进行治疗，目前多会使用抑制胃酸分泌、保护胃黏膜、促进胃动力等药物治疗。如果患有重度萎缩性胃炎的患者，同时伴有幽门螺旋杆菌感染，还需要加用抗生素类药物。
对于重度萎缩性胃炎的患者还存在一定的癌变几率，建议在医生指导下，规律性使用术相应的药物治疗。同时还需要定期进行胃镜复查，明确病情。