新生儿患有先天性心脏病，如果病情复杂，需要做心脏移植手术，要综合考虑新生儿的具体情况而定是否适宜做心脏移植手术。
新生儿原本生命体征不平稳、机体抵抗力弱，如果伴有先天性心脏病，会影响宝宝接受手术的适应能力。而且先天性心脏病进行手术时，如果宝宝年龄过小，可能会存在麻醉意外或者手术感染等高危因素。
因此，如果新生儿患有先天性心脏病，建议家长可以带宝宝前往正规三级以上的医院儿科就诊，这样才能综合性评定宝宝心脏的具体情况，然后医生会根据宝宝的具体病情看是否需要先进行保守治疗，待宝宝年龄稍大一些以后，能够适应进行心脏移植手术，再给予相应的手术治疗。