先天性心包缺损的预防，需要在孕期做好健康、保健工作，要提倡优生优育，在孕期要做好全方位的保健。
比如注意避免近亲结婚，做好一些遗传性疾病的咨询工作，还有产前诊断，孕妇尽可能避免酒精、药物、二手烟、甲醛等有毒有害物质、环境等，可以避免胎儿先天性畸形的发生。
先天性心包缺损治疗方面，如果是心包小缺损的，一般不需要进行外科手术治疗。对于部分心包缺损的患者，出现有症状、猝死可能性等情况的，需进行外科手术治疗，在手术结束后，还应该按时、按量服用药物。