2岁宝宝发烧39℃，要及时给予退烧的药物退烧，结合物理退烧以防高热惊厥。
出现39℃属于高烧的状态，可以给孩子服用布洛芬混悬液、对乙酰氨基酚等退烧药物。如果孩子不配合服用药物，也可以用退热栓塞肛门，也能起到退烧的作用。用冰袋放在腋下、腹股沟两侧等大动脉比较丰富的位置，能起到辅助退烧的效果。多给孩子饮用白开水，增加体内的液体量，通过多排小便有助于降温。
同时要前往医院，完善血常规等相关检查，确诊引起发烧的原因，及时治疗原发疾病。