新生儿脐肉芽肿时不建议使用滑石粉，因为脐肉芽肿是由于脐炎长期未治愈，或者是经过某些异物刺激引起的，滑石粉可能会造成脐部受到刺激而形成息肉样的小肉芽肿。除此之外，爽身粉、脐带粉都可能造成脐部的刺激，所以不建议给新生儿使用。
当发生新生儿脐肉芽肿的体积较小时，可以用生理盐水清洗肚脐部，然后用甲紫溶液涂抹，一般在7~10天后会痊愈。在此过程中要注意脐部的清洁、干燥，不要使脐部受到污染。
若新生儿脐肉芽肿体积较大，则需要在医生指导下，进行手术治疗。