咽部的良性畸胎瘤彻底切除肿瘤即可，无需其它特殊处理，术后远期效果好，复发率低。
咽部的恶性畸胎瘤则应按照恶性肿瘤治疗原则适当扩大切除范围，术中根据病变部位进行修复，并结合化疗，术后应注意随访。畸胎瘤发源于多胚层组织的先天性肿瘤，分为成熟畸胎瘤、良性畸胎瘤和不成熟畸胎瘤、恶性畸胎瘤。
手术宜在全麻下进行，以保证完整切除肿瘤和保持呼吸道通畅，防止并发症的发生。根据术后的病理，决定下一步的治疗方案。