小儿病毒性脑炎后遗症一般在得病后1~2周出现。
小儿病毒性脑炎也分为很多种类型。如果是普通的类型，只要诊断治疗及时，大多数是不会留有后遗症的。少数严重的病毒性脑炎，比如流行性乙型脑炎就有可能留有一定的后遗症。这种后遗症的出现时间，一般在治疗过程中就会出现一定的征兆，比如反复的昏迷、抽搐、意识障碍或者肢体功能异常，反复出现不能好转。
在后续的治疗过程中，超过2周以后仍然不能纠正，就可能导致后遗症的出现。常见的后遗症包括智力低下，运动功能的异常，以及继发的癫痫等。后遗症有可能终身携带。