隐睾症有可能会引起后遗症。如果睾丸发育正常，隐睾症只要及时通过手术治疗，就可以获得比较明显的效果。但如果睾丸先天发育就有缺陷，即使手术治疗，结合药物治疗，也有可能产生后遗症。
再者，手术也会带来一些风险，如手术意外等，也会引发一些后遗症的产生，常见的有生育能力下降，或是不孕症的产生。如果隐睾症已发生恶变，不但影响孩子成年后的男性功能，还可导致癌变转移身体其他器官等，影响健康，危及生命安全。
所以对于隐睾症的患者，要及时发现，及时治疗，且家长要努力配合医生，完成各项治疗措施，比如常见的激素治疗、手术治疗后配合激素治疗等。