对于吹空调腹泻的患者，如果腹泻症状比较严重时，可以服用具有收敛、止泻、调理肠道菌群等药物。目前常选择的药物有蒙脱石散或洛哌丁胺、双歧杆菌等，但是具体的药物名称及剂量，需要医生面诊后才可以选择。
对于腹泻的患者，如果同时还伴有腹痛、恶心、发热等症状出现时，需要及时检查大便常规，确定是否存在细菌或者是病毒感染可能性，然后选择敏感的抗菌药物进行治疗。
对于吹空调后出现腹泻症状的患者，除了使用药物调理外，还需要多注意腹部保暖。