眼角长扁平疣，可以通过外用软膏涂抹、激光治疗能够去除。
眼角长扁平疣与病毒感染有关，如果疣体较多，可以通过外用涂抹的方式治疗。可以在医生指导下给予干扰素凝胶、维A酸乳膏涂抹于患处。比如维A酸乳膏，里面主要成分是全反式维A酸，可适用于扁平疣、寻常痤疮、银屑病等疾病的辅助治疗。通过长时间应用药物涂抹，能去除眼角的扁平疣。
但是，药物使用时不能进入眼睛，避免对眼睛造成伤害。也可到医院的美容整形科就诊，可以通过激光分批、分次治疗，可以使扁平疣逐渐脱落。