有的子宫畸形有症状，比如月经异常、闭经、行经腹痛，成年以后还会发生不孕不育、胎位不正、习惯性流产等，但是有的子宫畸形没有任何临床表现。
是否有症状以及症状的严重程度，主要取决于缺陷的性质，一般始基子宫和幼稚子宫都会影响月经，出现月经量少、周期不稳、闭经，成年以后都影响生育。
而纵隔子宫、双角子宫、单角子宫、鞍状子宫等，在没有怀孕的情况下没有症状，所以一般不易发现，但怀孕后可能会出现反复流产、早产等情况。