引起小孩头疼、发烧的病因有感冒、肺炎、脑膜炎等。
1.感冒。如果患者感染病原微生物后，细菌在体内代谢出的产物作用于体内白细胞、淋巴细胞，产生并且释放致热原，并刺激头部血管黏膜及黏膜上神经末梢，所以出现上述症状。
2.肺炎。当细菌、病毒等病原微生物感染肺组织、肺泡时，容易引起肺泡变性及肺组织出现炎症反应，分泌炎性物质和血管活性物质。如炎症介质、多肽等，可以刺激大脑内的血管快速、频繁收缩或是舒张，出现上述症状。
3.脑膜炎。该疾病是由于病毒等刺激脑膜，脑膜出现炎性反应，分泌炎性物质夹杂于脑脊液中，参与脑部及身体反应，刺激中枢神经及脑实质，也会出现头疼、发热。