小儿神经管畸形的主要原因可能是在怀孕早期或者是怀孕前没有补充叶酸，导致患者出现了神经管的畸形。除此以外与在怀孕期特别是怀孕的早期有接触放射线或者是有毒有害的重金属时，也可能会导致患儿出现神经管畸形。
这种疾病主要的方式不是治疗而是预防，在怀孕前或者怀孕前的三个月期间，需要每天服用0.4毫克的叶酸，可以减少神经管畸形的发生。
并且需要做好产前的检查，如果出现了唐氏筛查高危，并且血清当中甲胎蛋白异常时需要做进一步的检查，必要时需要终止妊娠。