感染尼帕病毒癫痫发作，首先需要进行保护避免窒息，同时需要对病因进行治疗。
在尼帕病毒感染导致癫痫发作时，患者会因口腔大量分泌物误吸导致窒息症状。故在尼帕病毒感染癫痫发作时，需要首先清理患者呼吸道，同时调整患者体位，减少窒息风险。在一般体位摆放好后，需要根据病因进行对症治疗。
如患者是由于脑炎导致的癫痫急性发作，需要给予镇静、抗炎等治疗。如果患者是由于既往癫痫病史，在发热诱发下导致的癫痫急性发作，需要给予抗癫痫药物治疗。