喉咙右边吞咽疼可能有以下的原因：
1.右侧扁桃体周围炎或者扁桃体周围脓肿。病变炎症累及扁桃体周围间隙以及右侧的咽缩肌，导致患者出现吞咽疼痛感。
2.右侧舌咽神经痛。主要发生在右侧舌根部、右侧咽侧壁等部位，当患者吞咽、说话的时候，出现阵发性的、短暂的疼痛感。
3.右侧的茎突过长诱发导致。当患者右侧茎突长度超过2.5cm，在患者吞咽、转头等动作的时候，茎突刺激周围的神经、血管，可以诱发疼痛感。这种疼痛感大多数起源于右侧扁桃体窝内，可以向右侧邻近组织放射。
4.右侧的扁桃体癌症或者右侧下咽癌，都有可能会出现这种吞咽的时候出现右边的疼痛感，临床发生的概率不是很高。