在新冠疫情期间，对于有咳嗽发烧的患者需要注意排外有无新冠肺炎。但新冠肺炎并不都是有咳嗽发烧的症状，有时咳嗽发烧还可以见于其他的相关疾病。
新冠肺炎虽然以咳嗽、发烧、乏力为其主要表现，但此些症状是常见的临床表现，并不是新冠肺炎特有的症状，而且部分轻症的患者可能只有低热和乏力，而无咳嗽症状。故针对咳嗽发烧的患者要结合其有无新冠流行病学史、胸部影像学上是否有病毒性肺炎以及新冠核酸和特异性抗体检测是否为阳性，才能准确判断。
对于咳嗽发烧的患者多见于呼吸道感染性疾病，例如急性扁桃体炎、肺脓肿、肺结核等，部分非感染性疾病也可以引起咳嗽、发烧，例如免疫系统疾病及淋巴瘤伴有肺部浸润、肺癌等。