支气管结核和肺结核主要的区别是结核杆菌感染的部位不同。
支气管结核是由结核杆菌侵入支气管引起局部出现结核性病变。如果病情没有得到及时有效的治疗，可能会引起支气管瘘，而结核杆菌也可能顺着支气管周围组织感染，引起肺结核的病情发生。
肺结核是由结核杆菌侵入肺组织引起的结核性病变，这类患者也可能会出现周围组织感染，引起支气管结核、胸膜结核等疾病的病情发生。由于引起支气管结核和肺结核的病原体都是结核杆菌，所以都是使用抗结核药物进行治疗，常用的抗结核药物有异烟肼、利福平、吡嗪酰胺、乙胺丁醇等。