皮肤黏液瘤临床上主要的治疗方法是手术治疗。对于一些早期皮肤黏液瘤的患者，给予手术根治性的切除后，有少数的患者有可能获得临床治愈的效果。对于多数皮肤黏液瘤的患者，即使是早期的患者，有一些患者也会在术后出现局部的复发，从而导致患者病情的进展。
但是，皮肤黏液瘤主要以复发为主，临床上发生转移的几率非常低，因此总体来说，它发生疾病广泛转移的可能性低。放疗和化疗对于皮肤黏液瘤的疗效，目前并没有临床证据可以证实。
对于皮肤黏液瘤的患者，临床上它是一种较为罕见的肿瘤，肿瘤的进展速度并不是很快，而临床的预后情况总体尚可。