新生儿心肌炎是有可能会遗留后遗症的，主要是会影响到心脏的功能，导致心功能下降，主要后遗症会出现运动耐力下降、心脏供血能力下降，运动之后容易出现明显的疲劳感，甚至出现呼吸急促等表现。
所以当确诊新生儿出现心肌炎的问题以后，一定要积极地进行治疗，防止症状逐渐加重或者是持续，从而导致出现心肌炎或者是心肌损伤的情况。
当出现心肌炎的时候，护理上主要是注意，尽量避免让宝宝哭闹，多休息为主，并且积极配合医生进行治疗，疾病恢复得越快，遗留后遗症的可能性就越小。