龟头溃烂能够用高锰酸钾溶液清洗，可发挥消毒、杀菌以及收敛作用。还可将龟头溃烂部位的炎性分泌物清除，有利于溃烂创面新生组织填充，促使溃烂面愈合恢复。需要注意，高锰酸钾液需要低浓度配兑，可避免溃烂面的搔抓损伤。
还需要结合龟头溃烂的疾病诱因，针对性选择敏感药物治疗。由于使用阴茎套，或者进食某种敏感食材导致的过敏性溃烂，需要给予氯苯那敏药物抗过敏治疗。
由于念珠菌感染引起的龟头溃烂，需要选择制霉菌素、伊曲康唑等敏感药物抗炎治疗。