坏疽性脓皮病因其实验室检查和组织病理学表现没有明显的特异性，诊断属于排除性的诊断。
主要是根据其临床表现：临床出现炎症性的丘疹、脓疱、潜行性溃疡伴有剧烈的疼痛，好发于40-60岁的人群，可以做出初步的临床诊断。但必须要和其它相关类似的疾病进行鉴别，在诊断时要排除局部感染。
常见的鉴别诊断为感染性的溃疡、急性发热性嗜中性皮病、以及血管炎表现的一类综合征。感染性的疾病可以进行细菌培养鉴别。急性发热性嗜中性皮病不会发生潜行性的溃疡。一般坏疽性脓皮病无白细胞碎裂性血管炎的特征。