结核菌检阳性，提示着存在结核分枝杆菌的感染，但不能够判断疾病的严重程度。
如果结核菌对器官损伤严重，如肺结核形成多发性空洞或者是慢性纤维空洞型肺结核，这时疾病就比较严重。如果结核菌对组织的靶器官损伤较轻，疾病也就不严重。
结核菌涂片是确诊结核病最特异性的方法，涂片抗酸染色镜检快速简便。在我国肺结核分枝杆菌尚属少数，抗酸杆菌阳性，结核病诊断既可以成立。对于结合涂片可疑或者是诊断存疑的情况下，可以取标本进行结核菌培养。