手足口病常好发于婴幼儿及年龄比较小的儿童，该病最为常见、最为严重的并发症就是脑炎。严格意义上讲，脑炎并不是手足口病转成的，而是手足口病的并发症。
手足口病有重症病例和普通病例，其中脑炎等中枢神经系统感染属于重症病例，因此，会出现脑炎的相关症状。患者可表现为肌无力、头痛、呕吐、四肢发抖等症状。
如果存在高热不退的现象，没有及时控制，还容易引起昏迷、抽搐。这时需要积极采取抗病毒治疗，如果合并肺部感染，还需要应用一些敏感的抗生素进行抗感染治疗。