肛门疼和肛裂有关。
肛门疼痛是肛裂的主要症状，排便时粪便刺激肛门裂口或溃疡面内的末梢神经，会引起肛门烧灼样或刀割样疼痛。排便后由于肛门内括约肌痉挛，会出现肛门痉挛性疼痛，有的肛裂便后疼痛时间较长，呈周期性发作，难以忍受。
肛门疼，除了和肛裂有关以外，还和其他一些疾病有关，如得了血栓性外痔或内痔脱出肛门外，出现嵌顿，都会引起肛门疼痛。如得了肛周脓肿，会在肛周处出现肿块，由于感染和脓液形成，肿块处会出现红肿和疼痛。