男性自慰后出现腰痛，用现代医学的理论来解释，可能是自慰后导致局部腰肌劳损。可能是自慰后生殖附属性腺出现过度充血导致，也可能是自慰的体位选择导致腰部劳损，而出现腰痛。
中医认为，自慰尤其是频繁自慰容易出现肾精亏耗、腰府失养，气血不能濡养腰府可能会出现腰部疼痛，这是一种不荣则痛的表现。也可能是自慰导致局部气血运行不畅、气滞血瘀，气滞则痰凝，血瘀则湿停，从而出现腰部疼痛，这是一种不通则痛的表现。
所以，自慰后腰痛需要明确原因，明确证型才能决定下一步处理方法。