早上肚子痛的原因主要包括生理性和病理性等原因。
1.生理性的原因。大多数人会有早上排便的习惯，早上肚子痛可能是排便前的正常反应。
2.病理性的原因。前一天晚上吃得不干净或者进食一些难以消化的食物出现消化不良，也会出现早上肚子痛。胃肠功能紊乱引起的，常见的是肠易激综合征，表现为腹痛、腹泻，一般排便后可以缓解。患有肠道疾病，如肠炎，肠道感染后也会出现早上肚子痛的情况。另外，某些消化道疾病如胃溃疡、十二指肠溃疡或者是泌尿系统疾病也会出现早上肚子痛。
出现早上肚子痛的情况，一定要到医院进行相关检查，明确诊断后，对症治疗。平时要注意生活规律，注意饮食卫生，不要暴饮暴食。