脐尿管瘘一般不能进行保守治疗，保守治疗一般没有特别好的效果，主要是以手术治疗为主。
如果存在感染，应当先使用抗生素类的药物控制感染，将感染控制住后再进行手术切除。由于脐尿管疾病出现恶变的概率较高，因此在手术时尽量的将脐尿管周围的病变组织切除干净。
在手术过程当中也要注意保持腹膜的完整，避免对腹腔造成感染。如果在合并感染后与腹膜存在粘连，还应当将粘连的覆膜一并切除。如果不及时的进行治疗，脐尿管瘘很有可能会引起癌变，会危及患儿的生命。