眼药水可以混着滴，但不能同时滴。
一方面，眼药水在结膜囊内存留时间大概为5分钟，滴入的眼药水部分会被结膜吸收，其余的会沿着鼻泪管流到鼻腔。这一个过程结束以后，结膜囊又会恢复之前的空虚状态，此时就可以接着点用下一种眼药水。同时，结膜囊的容积只能容纳一滴眼药水的容量，因此应间歇点用眼药水。
临床上眼药水的制剂不多，暂时未发现有眼药水之间产生的不良反应。但是眼药水与口服药物之间，则会有药物相互作用，就诊时注意向医生讲述自己平常使用的药物，医生会及时调整用药。