针灸治疗头疼首先要明确病因，另一方面就是需要辨证施治，针对头疼的穴位治疗，一般来说多数是配伍以主穴为主。另外在辨证的基础之上根据证型适当配伍一些配穴。
治疗头疼的主穴，多数选择一些头部的穴位。多数可以选择，像是太阳，风池，印堂，头维，百会，翳风等这些头部的穴位为主。另外根据证型，如果说是肝郁气滞所导致的头痛，可以配伍四关，如果说是因为痰湿阻滞所导致的头痛，可以配伍丰隆穴，足三里穴。如果是因为肝肾亏虚所导致的头痛，可以选择像是太溪，肝俞，肾俞。另外，如果说是因为血瘀所导致的头痛，可以适当的配伍三阴交，血海等穴位。