牙根发黑需要针对其病因治疗：
1.牙根发黑有可能是牙结石造成。口腔卫生不洁，没有良好的刷牙习惯，牙菌斑长期滞留，继而钙化，形成牙结石。牙结石附着在牙颈部，久而久之引发牙龈炎、牙周炎，导致牙槽骨吸收、牙龈萎缩、牙根暴露，而暴露的牙根进一步附着牙结石。需要让专业的医生做系统牙周病治疗，包括龈上洁治、龈下刮治，并要保持口腔卫生清洁，减少菌斑的附着以及结石形成。
2.牙根发黑还有可能是牙齿根面龋。当各种原因导致牙齿根部暴露，发生龋坏也会发黑，这时需要针对龋齿做补牙治疗。