直肠如果有息肉，主要是通过药物治疗，或者通过手术切除治疗，还有一部分直肠息肉可以先观察为主。直肠息肉在发现之后，首先需要进一步确定息肉的性质，主要是通过病理组织学的检查。
如果息肉属于肿瘤性质的息肉，比如属于绒毛状腺瘤或者管状腺瘤性质的息肉，一般建议早做切除治疗。主要的目的是防止息肉出现癌变，严重影响到患者健康和生活，主要是在直视下进行切除，或者在肠镜下进行切除。
如果直肠息肉是由于直肠炎等疾病引起，一般治疗原发疾病，在直肠内炎症消退之后，息肉也有自行消除的可能性。如果是增生性的息肉，一般不会产生不适的症状，可以先观察为主，定期进行复查。