对于咽缩肌瘫痪患者治疗方法是根据患者实际病情采取针对病因治疗。对周围性麻痹患者可用抗胆碱酯酶剂(氢溴酸加兰他敏)或神经兴奋剂(士的宁)以及维生素B1治疗。
咽肌麻痹进食困难者宜插鼻饲管，以维持营养和防止吸入性肺炎的发生。新针疗法据报道可奏良效，常用穴位有风池、大椎、少商、廉泉、天枢、曲池等。
单侧咽缩肌瘫痪表现为患侧咽后壁如幕布样下垂、并拉向健侧、双侧瘫痪、则见咽后壁黏膜上的皱襞消失，触诊舌根或咽壁时咽反射消失，口咽及梨状窝有大量唾液潴留。