疱疹性咽峡炎，主要是由于肠道病毒感染而引起的，一种具有传染性的咽喉疾病，临床上针对疱疹性咽峡炎的治疗，主要是服用抗病毒的药物来进行治疗。
临床上，西药常用的抗病毒药物有利巴韦林、奥司他韦、阿昔洛韦等，也可以服用中成药进行抗病毒治疗。比如板蓝根、金银花、抗病毒口服液，也可以服用中药大青叶、金银花、连翘等药物进行治疗。
除了服用抗病毒的药物以外，口腔也可以使用口腔炎喷剂，来缓解口腔疼痛不适的症状。除了药物以外患者还要注意多喝水、避免吃辛辣、生硬的食物，以免刺激口腔引起疼痛。