消化不良是否能够根治，取决于引起消化不良的原因以及病人是否能保持健康的生活饮食习惯：
1.由于各种原因引起的胰腺外分泌功能不全、胆囊结石、炎症，小肠疾病如炎症性肠病、小肠淋巴瘤等。糖尿病胃肠轻瘫和脑血管病长期卧床导致的消化不良，因为不能去除病因，因此可能不能根治。
2.功能性胃肠病引起的消化不良，在改善不良生活习惯，如戒烟酒、减少高脂肪食物摄入、避免久坐、适当运动、减轻压力、改善睡眠后可以好转痊愈。如果病人不能注意保持健康生活方式，消化不良有反复发作可能。