羊水过少的胎儿有可能会导致智力不好的。有调查研究表明，发生羊水过少时，胎儿缺血、缺氧，甚至胎儿畸形发生率及围产儿病死率都会明显升高。
发生羊水过少时，孕妇的子宫相对比较敏感，外界轻微的刺激都可以导致引发宫缩，反复的宫缩可以使胎儿胎盘供血不足，胎儿发生缺血、缺氧。胎儿长期处于缺血、缺氧的环境中，容易导致胎儿大脑发育异常，严重者可以发生缺血、缺氧性脑病，新生儿出生之后智力会有问题。
另外，羊水过少时胎儿发生肌肉骨骼畸形，如：弓形腿、曲背、斜颈等的概率也会明显增加。