脑脓肿有可能会导致脑萎缩的情况出现，但是也要具体问题，具体地分析。如果脑脓肿不是非常地严重，经过及时地治疗以后，治疗效果比较好，脓肿消除，没有导致大脑神经功能的障碍，这种情况下就不至于导致脑萎缩的情况出现。
但是也有一些患者脑囊肿特别地厉害，引起了大面积的脑组织缺血坏死，这样治疗以后有可能就会导致脑萎缩的情况发生。
还有一些患者脑脓肿治疗以后引起了脑积水的情况，这样也会压迫大脑的皮质导致脑萎缩的现象。患者会出现明显的吸引能力下降、认知功能下降等症状。