通常情况下身材矮小的人，智力是正常。
导致身材矮小、身高低于同龄人的原因有很多，比如遗传因素，整个家族身高都比较矮小。或者低蛋白血症、贫血、长期的营养不良也会造成身材矮小。而一些疾病也会出现身材矮小，比如胃肠道功能不佳、肾脏疾病、肝脏疾病、维生素D缺乏，以上这些情况导致的身材矮小，患者一般智力是正常。
不过有一种疾病由于缺乏甲状腺激素，就会导致身材矮小，这种情况会使患者的智商受到影响，在临床上这种疾病称为先天性甲状腺功能减退症，是能够对人的大脑发育造成直接的影响。