身体过于肥胖，无法对结石进行定位，不能行体外震波碎石。患有急性的疾病，处在发热等状态的时候，也是不能行体外震波碎石的。有严重的心肺功能疾病，也不适合行体外碎石。当有血液系统的疾病、凝血功能异常，也不能行体外碎石。
如果结石的下方泌尿系统严重的梗阻，也不适宜行体外震波碎石。如果患者患有严重的泌尿系的感染，也不适合行体外碎石。
如果结石体积比较大，比如结石的直径超过了2cm，也不适合行体外碎石。