首先，对于腔隙性脑梗死的患者来说多数情况下，见于中老年患者，尤其以男性较为多见。多数患者有基础性疾病，比如有长期高血压、糖尿病等危险因素，病史通常发病较为突然起病急，进展速度较快。往往在病情进展过程中，出现了局灶性神经功能缺损的症状。临床表现主要表现为腔隙综合症，就可以对本病做出诊断。
如果头颅ct或者核磁检查证实有与神经功能缺失相一致的脑部腔隙型病灶，梗死灶的直径如果小于1.5到2.0厘米，往往就可以做出明确的诊断。疾病发病的部位多数累及脑组织的深部的白质、基底核、丘脑和脑桥的区域。符合大脑半球或脑干深部的小穿通动脉病变。鉴别诊断往往与少量的脑出血、感染、脑囊虫病、烟雾病、脑脓肿等疾病来进行鉴别。往往通过追问病史，发病后的临床表现以及头颅ct或者核磁影像学资料，可以做出相应的鉴别。