太阳病和少阴病的区别主要是病位不同以及证候的危重不同，另一方面，太阳病治疗不及时有可能循经传变到少阴病。
太阳病病位比较表浅、病情比较轻微，而少阴病病位比较深重，是六经传变中最后的层次和最危重的阶段。太阳病多由外感风寒导致，其症状可见头痛、项痛，或无汗或发热汗出，但都恶风，或可见身体疼痛，或可见小便不利，其脉象表现是浮脉。
少阴病指的是心肾阳虚，虚寒内生或心肾阴虚，阳热亢盛所表现的症状，属于疾病传变中最后的层次和比较危重的阶段，多出现精神疲惫、欲睡不得、似睡非睡的昏迷状态，可出现寒化和热化两种表现，脉象表现比较细微。