判断纯生殖细胞瘤需要根据辅助检查，还有临床表现判断，并且手术之后，还需要根据病理检查结果确诊。
生殖细胞瘤的典型临床表现是会导致内分泌的紊乱，在青春期孩子身上会表现为一个性早熟，同时，还有可能会有下丘脑的功能异常，比如嗜睡、肥胖这些症状，或者会有尿崩、烦渴的这些类似于糖尿病的症状。肿瘤生长部位不同，可能会发生的症状不同。
如果发生在松果体区，还有可能会阻塞脑导水管，造成颅内高压。CT的可以看见高密度的肿块，是没有出血和坏死的变化，但是会有分叶，而且边界是比较清楚，最终的判断，还是依靠手术之后的病理。