尖锐湿疣的检测方法包括HPV病毒的全套分型检测，以及病理学的检查方式，还有皮肤镜的检查方式，一般来说比较准确的是HPV病毒的全套分型和病理检查。
其中HPV全套分型检测是采集疑似尖锐湿疣皮损表面的脱落细胞，通过病毒学的分析判断是哪一种病毒性感染。如果是低危型的六型、十一型，或高危型的十六型，或十八型感染，则可以确诊为尖锐湿疣。
而病理学检测则是将疑似的皮损切除一块，然后固定切片，通过显微镜组织观察，从而判断是否有空泡样的细胞。而皮肤镜检测则主要是通过类似于放大镜一样的改变，观察比较细小的皮损，判断是否有颗粒样、菜花样的改变，但并不能够作为确诊试验。