如果分泌性中耳炎得不到及时治疗，其危害不小。如果分泌性中耳炎没有及时治疗，耳中分泌物增多，会导致鼓室硬化、粘连性中耳炎、胆固醇肉芽肿等继发性疾病，造成永久性听力损失，治疗非常困难。
清除中耳积液是为了改善中耳的通气和引流，常用的治疗方法包括鼓膜造口术、鼓膜切开术、鼓膜置管术等。同时也要保持鼻腔通畅，如果伴有鼻咽疾病也要积极治疗，必要时采取手术治疗。
一般来说，扁桃体肥大与分泌性中耳炎复发有关，可以通过药物或者手术治疗。