埃博拉病毒感染后，其症状主要表现为突然发热、恶心、呕吐、腹泻等，这些症状与重度感冒有一定相似处。当病情进一步恶化时，同时可能会伴有多个组织器官的出血，例如眼睛、耳朵、鼻孔等部位出血，更有甚者全身每个出孔都会有一定程度的出血发生。还可能会伴随血压下降、肤色变暗、呕血、黑便、蛋白尿、血尿等症状。
在埃博拉病毒感染的后期，可能会因失血性休克、心肌梗死、多器官功能衰竭等因素死亡。埃博拉病毒感染后的潜伏期一般为2-20天左右，但大多只有5-10天，起病很急。