甲亢有可能会导致不孕，甲亢的患者对于女性有可能会导致生殖系统出现异常，引起月经稀少，周期延长，甚至闭经，所以可能会影响到患者的正常的妊娠。但是部分患者还是可以正常的妊娠和生育，对于男性患者可能会导致性腺功能减退，出现阳痿，所以有可能也会影响到配偶的正常妊娠。
需要注意的就是，虽然女性患者会影响到正常的妊娠，因为部分患者还是能够正常妊娠。所以在服药的过程中，或者是在甲状腺毒症没有得到良好控制的时候，最好还是做好避孕工作。
因为抗甲状腺药物以及甲状腺毒症控制不良，有可能会导致出现不良的妊娠结局。