传染性软疣的治疗也是有相关药膏的。
选择药膏方面主要以抗病毒类的药膏为主，建议选择使用重组人干扰素凝胶来进行涂抹，这样可以在一定程度上降低这种疾病复发的概率。对于一些早期生长的小软疣也可以通过这种药膏的涂抹让其消退。
而对于已经成熟的传染性软疣，单纯选择涂抹药膏的效果并不是特别理想，需要先选择使用刮疣法，将软疣内部的软疣小体清除干净，然后在选择涂抹药物，这样既可以达到快速治疗的目的。又能够起到降低复发的作用，但是需要注意，这种药膏一天需要涂抹四次，所以要有耐心。